L’Agenzia, istituita con legge 127/97 ora TU 267/00, gestisce l’Albo dei Segretari comunali e provinciali.
Da essa dipendono i Segretari che operano presso i Comuni della Lombardia.
L’Agenzia fa parte del sistema degli Enti Locali, ha un proprio Consiglio di Amministrazione composto da due sindaci designati da ANCI, un presidente di provincia designato da UPI, due esperti designati dalla Conferenza Stato Città e Autonomie e tre segretari eletti da tutti i segretari.